Dès la conception du projet, Réseau Ferré de France a très étroitement associé les élus, la population et les organisations agricoles et forestières à l’ensemble des étapes. Cette démarche, basée sur la concertation et la transparence, a permis de retenir un tracé limitant les impacts sur les activités agricoles et sur l’environnement naturel et humain, sans sacrifier aux performances attendues.
La branche Est, qui reliera Dijon à Mulhouse, consiste à réaliser une ligne nouvelle de 190 kilomètres, entre Genlis (Côte d’Or) et Lutterbach (Haut-Rhin), ainsi que les raccordements au réseau existant.
La première phase de réalisation de 140 km a été définie entre Villers-les-Pots (Côte d’Or) et Petit-Croix (Territoire de Belfort).
Elle comprend également l’amélioration du raccordement de Perrigny dans le nœud ferroviaire dijonnais, ainsi que la création de deux gares nouvelles :
- Besançon Franche-Comté TGV à Auxon (Doubs)
- Belfort-Montbéliard TGV à Meroux-Moval (Territoire de Belfort)

